Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTLA4P16410 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CTLA4P16410 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTLA4P16410 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTLA4P16410 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTLA4P16410 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTLA4P16410 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTLA4P16410 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTLA4P16410 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTLA4P16410 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTLA4P16410 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTLA4P16410 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTLA4P16410 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTLA4P16410 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTLA4P16410 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTLA4P16410 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTLA4P16410 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTLA4P16410 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTLA4P16410 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTLA4P16410 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTLA4P16410 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTLA4P16410 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTLA4P16410 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTLA4P16410 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTLA4P16410 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTLA4P16410 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTLA4P16410 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTLA4P16410 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTLA4P16410 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms