Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSPP15924 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSPP15924 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSPP15924 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSPP15924 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSPP15924 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSPP15924 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSPP15924 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSPP15924 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSPP15924 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSPP15924 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSPP15924 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSPP15924 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSPP15924 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSPP15924 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSPP15924 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSPP15924 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSPP15924 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSPP15924 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSPP15924 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSPP15924 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSPP15924 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSPP15924 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSPP15924 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSPP15924 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSPP15924 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DSPP15924 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSPP15924 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSPP15924 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSPP15924 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSPP15924 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSPP15924 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSPP15924 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSPP15924 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSPP15924 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSPP15924 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSPP15924 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSPP15924 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSPP15924 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSPP15924 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSPP15924 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSPP15924 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSPP15924 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSPP15924 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSPP15924 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSPP15924 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DSPP15924 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSPP15924 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSPP15924 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DSPP15924 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSPP15924 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSPP15924 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSPP15924 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSPP15924 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSPP15924 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSPP15924 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSPP15924 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSPP15924 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSPP15924 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSPP15924 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSPP15924 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DSPP15924 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSPP15924 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSPP15924 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSPP15924 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSPP15924 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSPP15924 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DSPP15924 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSPP15924 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSPP15924 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSPP15924 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DSPP15924 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSPP15924 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSPP15924 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSPP15924 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSPP15924 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSPP15924 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSPP15924 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSPP15924 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSPP15924 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DSPP15924 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSPP15924 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSPP15924 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSPP15924 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms