Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
P4HA1P13674 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4HA1P13674 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P4HA1P13674 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms