Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CFTRP13569 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CFTRP13569 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CFTRP13569 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CFTRP13569 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CFTRP13569 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CFTRP13569 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CFTRP13569 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CFTRP13569 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
CFTRP13569 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CFTRP13569 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CFTRP13569 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CFTRP13569 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CFTRP13569 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CFTRP13569 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFTRP13569 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFTRP13569 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFTRP13569 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFTRP13569 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFTRP13569 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFTRP13569 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CFTRP13569 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
CFTRP13569 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CFTRP13569 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CFTRP13569 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
CFTRP13569 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CFTRP13569 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CFTRP13569 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CFTRP13569 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CFTRP13569 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CFTRP13569 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CFTRP13569 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CFTRP13569 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CFTRP13569 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CFTRP13569 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CFTRP13569 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CFTRP13569 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CFTRP13569 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CFTRP13569 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CFTRP13569 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CFTRP13569 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CFTRP13569 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CFTRP13569 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CFTRP13569 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CFTRP13569 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CFTRP13569 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
CFTRP13569 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CFTRP13569 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CFTRP13569 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CFTRP13569 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CFTRP13569 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CFTRP13569 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
CFTRP13569 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CFTRP13569 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CFTRP13569 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CFTRP13569 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CFTRP13569 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CFTRP13569 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CFTRP13569 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
CFTRP13569 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CFTRP13569 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CFTRP13569 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CFTRP13569 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CFTRP13569 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CFTRP13569 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CFTRP13569 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CFTRP13569 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CFTRP13569 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CFTRP13569 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CFTRP13569 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CFTRP13569 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CFTRP13569 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
CFTRP13569 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CFTRP13569 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CFTRP13569 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CFTRP13569 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CFTRP13569 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CFTRP13569 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CFTRP13569 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CFTRP13569 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CFTRP13569 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
CFTRP13569 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CFTRP13569 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CFTRP13569 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.31
CFTRP13569 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CFTRP13569 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CFTRP13569 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CFTRP13569 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
CFTRP13569 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CFTRP13569 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CFTRP13569 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CFTRP13569 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CFTRP13569 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CFTRP13569 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CFTRP13569 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CFTRP13569 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CFTRP13569 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CFTRP13569 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CFTRP13569 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
CFTRP13569 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms