Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BBP13224 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GP1BBP13224 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms