Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
COL11A1P12107 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL11A1P12107 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL11A1P12107 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms