Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP2C9P11712 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP2C9P11712 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms