Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD1P11586 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms