Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBL4AP11441 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL4AP11441 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL4AP11441 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms