Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR89BP0CG08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR89BP0CG08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms