Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
POLA1P09884 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
POLA1P09884 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
POLA1P09884 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
POLA1P09884 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
POLA1P09884 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
POLA1P09884 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
POLA1P09884 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
POLA1P09884 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
POLA1P09884 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
POLA1P09884 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
POLA1P09884 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
POLA1P09884 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
POLA1P09884 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
POLA1P09884 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
POLA1P09884 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
POLA1P09884 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
POLA1P09884 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
POLA1P09884 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
POLA1P09884 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
POLA1P09884 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
POLA1P09884 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
POLA1P09884 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
POLA1P09884 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
POLA1P09884 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
POLA1P09884 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
POLA1P09884 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
POLA1P09884 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
POLA1P09884 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
POLA1P09884 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
POLA1P09884 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
POLA1P09884 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
POLA1P09884 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
POLA1P09884 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
POLA1P09884 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
POLA1P09884 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC40.91■■■■■ 4.14
POLA1P09884 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
POLA1P09884 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.9■■■■■ 4.14
POLA1P09884 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
POLA1P09884 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
POLA1P09884 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
POLA1P09884 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
POLA1P09884 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
POLA1P09884 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
POLA1P09884 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
POLA1P09884 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
POLA1P09884 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
POLA1P09884 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
POLA1P09884 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
POLA1P09884 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
POLA1P09884 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
POLA1P09884 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
POLA1P09884 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
POLA1P09884 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.85■■■■■ 4.13
POLA1P09884 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
POLA1P09884 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
POLA1P09884 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
POLA1P09884 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
POLA1P09884 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
POLA1P09884 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
POLA1P09884 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
POLA1P09884 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
POLA1P09884 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
POLA1P09884 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
POLA1P09884 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
POLA1P09884 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
POLA1P09884 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
POLA1P09884 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
POLA1P09884 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
POLA1P09884 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
POLA1P09884 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
POLA1P09884 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
POLA1P09884 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
POLA1P09884 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
POLA1P09884 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
POLA1P09884 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
POLA1P09884 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
POLA1P09884 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
POLA1P09884 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
POLA1P09884 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
POLA1P09884 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
POLA1P09884 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
POLA1P09884 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
POLA1P09884 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
POLA1P09884 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
POLA1P09884 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
POLA1P09884 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC40.76■■■■■ 4.12
POLA1P09884 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
POLA1P09884 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
POLA1P09884 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
POLA1P09884 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
POLA1P09884 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
POLA1P09884 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
POLA1P09884 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
POLA1P09884 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
POLA1P09884 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
POLA1P09884 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
POLA1P09884 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
POLA1P09884 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
POLA1P09884 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms