Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP1P09455 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP1P09455 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP1P09455 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP1P09455 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP1P09455 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP1P09455 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP1P09455 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP1P09455 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP1P09455 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP1P09455 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP1P09455 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP1P09455 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP1P09455 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP1P09455 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP1P09455 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP1P09455 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP1P09455 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP1P09455 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP1P09455 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP1P09455 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP1P09455 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP1P09455 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP1P09455 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP1P09455 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP1P09455 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP1P09455 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP1P09455 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP1P09455 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP1P09455 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP1P09455 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP1P09455 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP1P09455 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP1P09455 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP1P09455 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP1P09455 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP1P09455 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP1P09455 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP1P09455 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP1P09455 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP1P09455 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP1P09455 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP1P09455 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP1P09455 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP1P09455 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP1P09455 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP1P09455 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP1P09455 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP1P09455 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP1P09455 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP1P09455 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP1P09455 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP1P09455 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP1P09455 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP1P09455 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP1P09455 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP1P09455 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP1P09455 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP1P09455 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP1P09455 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP1P09455 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP1P09455 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP1P09455 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP1P09455 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP1P09455 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP1P09455 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP1P09455 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP1P09455 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP1P09455 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP1P09455 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP1P09455 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP1P09455 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP1P09455 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP1P09455 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP1P09455 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP1P09455 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP1P09455 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP1P09455 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP1P09455 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP1P09455 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP1P09455 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP1P09455 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP1P09455 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP1P09455 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP1P09455 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms