Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRCP08575 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRCP08575 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
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