Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOP08100 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOP08100 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOP08100 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOP08100 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOP08100 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOP08100 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOP08100 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOP08100 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOP08100 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOP08100 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOP08100 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOP08100 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOP08100 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOP08100 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOP08100 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOP08100 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOP08100 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOP08100 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOP08100 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOP08100 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOP08100 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOP08100 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOP08100 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOP08100 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOP08100 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOP08100 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOP08100 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOP08100 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOP08100 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOP08100 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOP08100 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOP08100 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOP08100 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOP08100 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOP08100 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOP08100 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOP08100 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOP08100 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOP08100 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOP08100 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOP08100 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOP08100 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOP08100 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOP08100 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOP08100 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOP08100 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOP08100 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOP08100 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOP08100 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOP08100 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOP08100 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOP08100 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOP08100 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOP08100 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOP08100 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOP08100 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOP08100 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOP08100 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOP08100 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOP08100 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOP08100 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOP08100 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOP08100 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOP08100 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOP08100 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOP08100 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOP08100 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOP08100 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOP08100 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOP08100 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOP08100 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOP08100 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOP08100 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOP08100 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOP08100 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOP08100 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOP08100 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOP08100 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOP08100 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOP08100 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms