Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSBP07858 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSBP07858 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSBP07858 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSBP07858 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSBP07858 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSBP07858 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSBP07858 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSBP07858 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSBP07858 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSBP07858 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSBP07858 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSBP07858 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSBP07858 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSBP07858 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSBP07858 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSBP07858 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSBP07858 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSBP07858 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSBP07858 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSBP07858 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSBP07858 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSBP07858 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSBP07858 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSBP07858 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSBP07858 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSBP07858 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSBP07858 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSBP07858 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSBP07858 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSBP07858 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSBP07858 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSBP07858 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSBP07858 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSBP07858 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSBP07858 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSBP07858 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSBP07858 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSBP07858 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSBP07858 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSBP07858 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSBP07858 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSBP07858 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSBP07858 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSBP07858 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSBP07858 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSBP07858 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSBP07858 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSBP07858 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSBP07858 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSBP07858 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSBP07858 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSBP07858 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSBP07858 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSBP07858 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSBP07858 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSBP07858 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSBP07858 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSBP07858 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSBP07858 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSBP07858 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSBP07858 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSBP07858 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSBP07858 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSBP07858 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSBP07858 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSBP07858 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSBP07858 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSBP07858 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSBP07858 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSBP07858 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSBP07858 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSBP07858 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSBP07858 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSBP07858 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSBP07858 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSBP07858 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSBP07858 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSBP07858 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSBP07858 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSBP07858 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSBP07858 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms