Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBB4AP04350 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4AP04350 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 336.2 ms