Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA2P02652 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA2P02652 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA2P02652 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA2P02652 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA2P02652 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA2P02652 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA2P02652 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA2P02652 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA2P02652 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA2P02652 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA2P02652 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA2P02652 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA2P02652 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA2P02652 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA2P02652 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA2P02652 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOA2P02652 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOA2P02652 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOA2P02652 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOA2P02652 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA2P02652 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA2P02652 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA2P02652 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA2P02652 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA2P02652 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA2P02652 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA2P02652 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA2P02652 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA2P02652 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA2P02652 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA2P02652 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA2P02652 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA2P02652 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA2P02652 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA2P02652 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA2P02652 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA2P02652 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA2P02652 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA2P02652 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA2P02652 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA2P02652 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA2P02652 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA2P02652 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA2P02652 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA2P02652 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA2P02652 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA2P02652 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA2P02652 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOA2P02652 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOA2P02652 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
APOA2P02652 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOA2P02652 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOA2P02652 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOA2P02652 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOA2P02652 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOA2P02652 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOA2P02652 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOA2P02652 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
APOA2P02652 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOA2P02652 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOA2P02652 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOA2P02652 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOA2P02652 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOA2P02652 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOA2P02652 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOA2P02652 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOA2P02652 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOA2P02652 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOA2P02652 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms