Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL4A1P02462 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL4A1P02462 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL4A1P02462 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A1P02462 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A1P02462 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A1P02462 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A1P02462 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A1P02462 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL4A1P02462 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A1P02462 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A1P02462 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
COL4A1P02462 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL4A1P02462 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL4A1P02462 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL4A1P02462 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms