Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms