Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD3O95983 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD3O95983 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD3O95983 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD3O95983 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD3O95983 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD3O95983 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MBD3O95983 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MBD3O95983 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD3O95983 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD3O95983 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD3O95983 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD3O95983 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD3O95983 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD3O95983 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD3O95983 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD3O95983 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD3O95983 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD3O95983 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD3O95983 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD3O95983 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD3O95983 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD3O95983 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD3O95983 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD3O95983 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD3O95983 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD3O95983 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD3O95983 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD3O95983 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD3O95983 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD3O95983 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD3O95983 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD3O95983 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD3O95983 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD3O95983 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD3O95983 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD3O95983 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD3O95983 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD3O95983 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD3O95983 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD3O95983 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MBD3O95983 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MBD3O95983 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MBD3O95983 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MBD3O95983 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MBD3O95983 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MBD3O95983 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MBD3O95983 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD3O95983 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD3O95983 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD3O95983 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD3O95983 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD3O95983 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD3O95983 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD3O95983 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD3O95983 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD3O95983 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD3O95983 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD3O95983 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD3O95983 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD3O95983 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD3O95983 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD3O95983 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD3O95983 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD3O95983 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD3O95983 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD3O95983 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD3O95983 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD3O95983 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD3O95983 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD3O95983 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD3O95983 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD3O95983 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD3O95983 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD3O95983 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD3O95983 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD3O95983 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD3O95983 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD3O95983 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD3O95983 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD3O95983 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD3O95983 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD3O95983 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD3O95983 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD3O95983 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD3O95983 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD3O95983 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD3O95983 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD3O95983 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD3O95983 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD3O95983 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD3O95983 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD3O95983 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD3O95983 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD3O95983 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD3O95983 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD3O95983 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD3O95983 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD3O95983 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD3O95983 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms