Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC3O95833 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms