Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4FO95754 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms