Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL3O95573 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL3O95573 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms