Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MATN4O95460 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MATN4O95460 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MATN4O95460 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN4O95460 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN4O95460 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN4O95460 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN4O95460 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN4O95460 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN4O95460 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN4O95460 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN4O95460 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN4O95460 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN4O95460 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN4O95460 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN4O95460 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN4O95460 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN4O95460 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN4O95460 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MATN4O95460 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MATN4O95460 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MATN4O95460 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MATN4O95460 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MATN4O95460 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MATN4O95460 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MATN4O95460 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MATN4O95460 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MATN4O95460 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MATN4O95460 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MATN4O95460 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MATN4O95460 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MATN4O95460 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MATN4O95460 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN4O95460 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MATN4O95460 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MATN4O95460 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MATN4O95460 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MATN4O95460 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MATN4O95460 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MATN4O95460 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MATN4O95460 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN4O95460 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN4O95460 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN4O95460 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN4O95460 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN4O95460 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN4O95460 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN4O95460 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN4O95460 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN4O95460 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MATN4O95460 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MATN4O95460 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MATN4O95460 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MATN4O95460 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MATN4O95460 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MATN4O95460 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MATN4O95460 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN4O95460 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN4O95460 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN4O95460 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN4O95460 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN4O95460 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MATN4O95460 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MATN4O95460 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MATN4O95460 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN4O95460 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN4O95460 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN4O95460 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN4O95460 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN4O95460 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN4O95460 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN4O95460 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN4O95460 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN4O95460 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN4O95460 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN4O95460 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN4O95460 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN4O95460 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN4O95460 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN4O95460 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN4O95460 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN4O95460 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN4O95460 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN4O95460 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN4O95460 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN4O95460 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN4O95460 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MATN4O95460 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MATN4O95460 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MATN4O95460 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms