Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCA5LO95447 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5LO95447 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms