Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCELO95171 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCELO95171 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCELO95171 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCELO95171 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCELO95171 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCELO95171 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCELO95171 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCELO95171 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCELO95171 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCELO95171 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCELO95171 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCELO95171 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCELO95171 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCELO95171 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCELO95171 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCELO95171 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCELO95171 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCELO95171 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCELO95171 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCELO95171 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCELO95171 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCELO95171 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCELO95171 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCELO95171 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCELO95171 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCELO95171 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCELO95171 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCELO95171 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCELO95171 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCELO95171 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCELO95171 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCELO95171 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCELO95171 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCELO95171 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCELO95171 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCELO95171 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCELO95171 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCELO95171 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCELO95171 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCELO95171 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCELO95171 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCELO95171 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCELO95171 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCELO95171 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCELO95171 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCELO95171 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCELO95171 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCELO95171 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCELO95171 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCELO95171 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCELO95171 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCELO95171 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCELO95171 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCELO95171 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCELO95171 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCELO95171 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCELO95171 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCELO95171 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCELO95171 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCELO95171 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCELO95171 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCELO95171 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCELO95171 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCELO95171 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCELO95171 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCELO95171 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCELO95171 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCELO95171 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCELO95171 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCELO95171 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCELO95171 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCELO95171 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCELO95171 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCELO95171 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCELO95171 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCELO95171 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCELO95171 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCELO95171 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCELO95171 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCELO95171 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCELO95171 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCELO95171 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCELO95171 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCELO95171 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCELO95171 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCELO95171 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCELO95171 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCELO95171 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCELO95171 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCELO95171 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms