Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK1O94907 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK1O94907 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK1O94907 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK1O94907 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK1O94907 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK1O94907 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK1O94907 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK1O94907 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK1O94907 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK1O94907 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK1O94907 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DKK1O94907 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DKK1O94907 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DKK1O94907 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK1O94907 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK1O94907 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK1O94907 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK1O94907 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DKK1O94907 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DKK1O94907 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DKK1O94907 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DKK1O94907 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DKK1O94907 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK1O94907 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK1O94907 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK1O94907 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK1O94907 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK1O94907 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK1O94907 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK1O94907 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK1O94907 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK1O94907 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK1O94907 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK1O94907 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK1O94907 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK1O94907 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK1O94907 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK1O94907 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK1O94907 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK1O94907 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK1O94907 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK1O94907 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK1O94907 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK1O94907 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK1O94907 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK1O94907 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK1O94907 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK1O94907 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK1O94907 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK1O94907 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK1O94907 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DKK1O94907 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK1O94907 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK1O94907 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK1O94907 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK1O94907 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK1O94907 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK1O94907 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DKK1O94907 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DKK1O94907 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DKK1O94907 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DKK1O94907 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK1O94907 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DKK1O94907 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DKK1O94907 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DKK1O94907 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DKK1O94907 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DKK1O94907 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK1O94907 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK1O94907 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK1O94907 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK1O94907 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK1O94907 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK1O94907 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK1O94907 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK1O94907 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DKK1O94907 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DKK1O94907 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DKK1O94907 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DKK1O94907 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DKK1O94907 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DKK1O94907 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DKK1O94907 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DKK1O94907 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK1O94907 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK1O94907 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK1O94907 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK1O94907 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK1O94907 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK1O94907 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms