Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF6O94906 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF6O94906 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms