Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRPM2O94759 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRPM2O94759 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRPM2O94759 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms