Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD17O75943 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD17O75943 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD17O75943 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD17O75943 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD17O75943 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD17O75943 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD17O75943 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD17O75943 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD17O75943 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD17O75943 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD17O75943 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD17O75943 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD17O75943 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD17O75943 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD17O75943 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD17O75943 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD17O75943 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD17O75943 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD17O75943 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD17O75943 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD17O75943 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD17O75943 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD17O75943 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD17O75943 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD17O75943 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD17O75943 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD17O75943 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD17O75943 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD17O75943 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD17O75943 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD17O75943 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD17O75943 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD17O75943 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD17O75943 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD17O75943 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD17O75943 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD17O75943 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD17O75943 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD17O75943 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD17O75943 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD17O75943 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD17O75943 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RAD17O75943 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD17O75943 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD17O75943 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD17O75943 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD17O75943 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD17O75943 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD17O75943 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD17O75943 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD17O75943 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD17O75943 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD17O75943 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD17O75943 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD17O75943 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD17O75943 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD17O75943 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD17O75943 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD17O75943 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD17O75943 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD17O75943 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD17O75943 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD17O75943 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD17O75943 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD17O75943 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD17O75943 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAD17O75943 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAD17O75943 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD17O75943 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD17O75943 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD17O75943 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD17O75943 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD17O75943 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD17O75943 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD17O75943 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD17O75943 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD17O75943 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD17O75943 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD17O75943 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD17O75943 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms