Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN3O75935 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.4 ms