Protein–RNA interactions for Protein: O75677

RFPL1, Ret finger protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL1O75677 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFPL1O75677 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL1O75677 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms