Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMUO75648 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMUO75648 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMUO75648 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMUO75648 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMUO75648 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMUO75648 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMUO75648 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMUO75648 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMUO75648 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMUO75648 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMUO75648 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMUO75648 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMUO75648 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMUO75648 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMUO75648 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMUO75648 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMUO75648 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMUO75648 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMUO75648 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMUO75648 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMUO75648 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMUO75648 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMUO75648 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMUO75648 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMUO75648 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMUO75648 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMUO75648 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMUO75648 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMUO75648 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMUO75648 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMUO75648 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMUO75648 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMUO75648 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMUO75648 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMUO75648 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMUO75648 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMUO75648 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMUO75648 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMUO75648 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMUO75648 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMUO75648 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMUO75648 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMUO75648 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMUO75648 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMUO75648 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMUO75648 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMUO75648 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMUO75648 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMUO75648 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMUO75648 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMUO75648 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMUO75648 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMUO75648 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMUO75648 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMUO75648 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMUO75648 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMUO75648 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMUO75648 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMUO75648 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMUO75648 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMUO75648 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMUO75648 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMUO75648 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMUO75648 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMUO75648 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMUO75648 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMUO75648 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMUO75648 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMUO75648 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMUO75648 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMUO75648 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMUO75648 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMUO75648 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMUO75648 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMUO75648 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMUO75648 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMUO75648 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms