Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM3O75382 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM3O75382 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM3O75382 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms