Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOL3O60936 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOL3O60936 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOL3O60936 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOL3O60936 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOL3O60936 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOL3O60936 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOL3O60936 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOL3O60936 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOL3O60936 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOL3O60936 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOL3O60936 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOL3O60936 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOL3O60936 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOL3O60936 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOL3O60936 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOL3O60936 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOL3O60936 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOL3O60936 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOL3O60936 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOL3O60936 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOL3O60936 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOL3O60936 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOL3O60936 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOL3O60936 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOL3O60936 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOL3O60936 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOL3O60936 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOL3O60936 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOL3O60936 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOL3O60936 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOL3O60936 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOL3O60936 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOL3O60936 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOL3O60936 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOL3O60936 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOL3O60936 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOL3O60936 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOL3O60936 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOL3O60936 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOL3O60936 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOL3O60936 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOL3O60936 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOL3O60936 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOL3O60936 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOL3O60936 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOL3O60936 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NOL3O60936 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOL3O60936 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOL3O60936 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOL3O60936 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOL3O60936 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOL3O60936 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOL3O60936 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NOL3O60936 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOL3O60936 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOL3O60936 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOL3O60936 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOL3O60936 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOL3O60936 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOL3O60936 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOL3O60936 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOL3O60936 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOL3O60936 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOL3O60936 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOL3O60936 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOL3O60936 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOL3O60936 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOL3O60936 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOL3O60936 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOL3O60936 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOL3O60936 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOL3O60936 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOL3O60936 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOL3O60936 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOL3O60936 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOL3O60936 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms