Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLOD3O60568 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD3O60568 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms