Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8B3O60423 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8B3O60423 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms