Protein–RNA interactions for Protein: O43929

ORC4, Origin recognition complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC4O43929 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ORC4O43929 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ORC4O43929 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ORC4O43929 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ORC4O43929 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ORC4O43929 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ORC4O43929 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ORC4O43929 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ORC4O43929 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ORC4O43929 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ORC4O43929 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ORC4O43929 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ORC4O43929 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ORC4O43929 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ORC4O43929 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ORC4O43929 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ORC4O43929 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ORC4O43929 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ORC4O43929 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ORC4O43929 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ORC4O43929 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC4O43929 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC4O43929 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC4O43929 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC4O43929 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC4O43929 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC4O43929 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ORC4O43929 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC4O43929 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC4O43929 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC4O43929 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC4O43929 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC4O43929 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC4O43929 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC4O43929 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ORC4O43929 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ORC4O43929 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ORC4O43929 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ORC4O43929 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ORC4O43929 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ORC4O43929 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ORC4O43929 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ORC4O43929 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC4O43929 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC4O43929 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC4O43929 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC4O43929 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC4O43929 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC4O43929 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ORC4O43929 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ORC4O43929 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ORC4O43929 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ORC4O43929 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ORC4O43929 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ORC4O43929 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ORC4O43929 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC4O43929 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC4O43929 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC4O43929 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC4O43929 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC4O43929 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC4O43929 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ORC4O43929 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ORC4O43929 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ORC4O43929 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ORC4O43929 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ORC4O43929 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ORC4O43929 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC4O43929 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC4O43929 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC4O43929 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC4O43929 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC4O43929 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC4O43929 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC4O43929 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC4O43929 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC4O43929 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC4O43929 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC4O43929 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC4O43929 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC4O43929 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC4O43929 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC4O43929 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC4O43929 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC4O43929 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC4O43929 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC4O43929 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC4O43929 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC4O43929 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC4O43929 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC4O43929 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC4O43929 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC4O43929 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC4O43929 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ORC4O43929 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ORC4O43929 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ORC4O43929 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ORC4O43929 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ORC4O43929 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ORC4O43929 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms