Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP9O43818 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP9O43818 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RRP9O43818 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RRP9O43818 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RRP9O43818 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP9O43818 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP9O43818 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP9O43818 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP9O43818 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP9O43818 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP9O43818 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP9O43818 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP9O43818 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP9O43818 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP9O43818 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP9O43818 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP9O43818 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP9O43818 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP9O43818 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP9O43818 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP9O43818 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP9O43818 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP9O43818 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP9O43818 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP9O43818 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP9O43818 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP9O43818 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP9O43818 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP9O43818 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP9O43818 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP9O43818 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP9O43818 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP9O43818 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP9O43818 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP9O43818 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP9O43818 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP9O43818 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP9O43818 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP9O43818 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP9O43818 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP9O43818 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP9O43818 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP9O43818 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP9O43818 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP9O43818 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP9O43818 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP9O43818 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP9O43818 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP9O43818 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP9O43818 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP9O43818 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP9O43818 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP9O43818 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP9O43818 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP9O43818 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP9O43818 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP9O43818 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP9O43818 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP9O43818 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP9O43818 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP9O43818 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP9O43818 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP9O43818 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP9O43818 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP9O43818 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP9O43818 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP9O43818 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP9O43818 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP9O43818 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP9O43818 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP9O43818 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP9O43818 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP9O43818 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP9O43818 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP9O43818 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP9O43818 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP9O43818 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP9O43818 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP9O43818 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP9O43818 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms