Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR3O43761 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR3O43761 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms