Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB2O43679 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB2O43679 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB2O43679 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB2O43679 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB2O43679 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB2O43679 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB2O43679 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB2O43679 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB2O43679 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB2O43679 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB2O43679 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB2O43679 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB2O43679 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDB2O43679 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDB2O43679 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDB2O43679 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LDB2O43679 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDB2O43679 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB2O43679 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB2O43679 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB2O43679 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB2O43679 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB2O43679 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB2O43679 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB2O43679 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDB2O43679 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LDB2O43679 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDB2O43679 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDB2O43679 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDB2O43679 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDB2O43679 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDB2O43679 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDB2O43679 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDB2O43679 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDB2O43679 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDB2O43679 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB2O43679 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB2O43679 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB2O43679 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB2O43679 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB2O43679 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB2O43679 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB2O43679 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB2O43679 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDB2O43679 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDB2O43679 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDB2O43679 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDB2O43679 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDB2O43679 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDB2O43679 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDB2O43679 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDB2O43679 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LDB2O43679 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB2O43679 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB2O43679 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB2O43679 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB2O43679 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB2O43679 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB2O43679 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB2O43679 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDB2O43679 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDB2O43679 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDB2O43679 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDB2O43679 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LDB2O43679 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB2O43679 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB2O43679 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB2O43679 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB2O43679 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB2O43679 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB2O43679 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB2O43679 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB2O43679 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB2O43679 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB2O43679 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB2O43679 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB2O43679 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDB2O43679 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDB2O43679 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms