Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERI3O43414 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERI3O43414 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERI3O43414 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERI3O43414 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERI3O43414 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERI3O43414 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERI3O43414 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERI3O43414 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERI3O43414 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERI3O43414 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERI3O43414 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERI3O43414 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERI3O43414 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERI3O43414 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERI3O43414 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERI3O43414 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERI3O43414 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERI3O43414 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERI3O43414 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERI3O43414 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERI3O43414 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERI3O43414 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERI3O43414 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERI3O43414 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERI3O43414 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERI3O43414 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERI3O43414 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERI3O43414 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERI3O43414 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERI3O43414 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERI3O43414 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERI3O43414 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERI3O43414 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERI3O43414 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERI3O43414 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERI3O43414 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERI3O43414 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERI3O43414 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERI3O43414 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERI3O43414 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERI3O43414 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERI3O43414 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERI3O43414 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERI3O43414 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERI3O43414 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERI3O43414 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERI3O43414 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERI3O43414 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERI3O43414 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERI3O43414 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERI3O43414 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERI3O43414 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERI3O43414 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERI3O43414 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERI3O43414 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERI3O43414 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERI3O43414 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERI3O43414 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERI3O43414 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERI3O43414 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERI3O43414 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERI3O43414 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERI3O43414 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERI3O43414 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERI3O43414 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERI3O43414 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERI3O43414 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERI3O43414 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERI3O43414 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERI3O43414 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERI3O43414 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERI3O43414 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERI3O43414 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERI3O43414 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERI3O43414 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERI3O43414 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERI3O43414 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERI3O43414 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERI3O43414 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERI3O43414 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERI3O43414 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERI3O43414 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERI3O43414 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERI3O43414 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERI3O43414 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERI3O43414 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERI3O43414 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERI3O43414 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERI3O43414 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms