Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATMINO43313 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATMINO43313 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATMINO43313 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATMINO43313 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATMINO43313 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATMINO43313 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATMINO43313 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATMINO43313 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATMINO43313 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATMINO43313 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATMINO43313 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATMINO43313 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATMINO43313 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATMINO43313 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATMINO43313 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATMINO43313 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATMINO43313 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATMINO43313 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMINO43313 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATMINO43313 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATMINO43313 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATMINO43313 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATMINO43313 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATMINO43313 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATMINO43313 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATMINO43313 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATMINO43313 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATMINO43313 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATMINO43313 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATMINO43313 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATMINO43313 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATMINO43313 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATMINO43313 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATMINO43313 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATMINO43313 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATMINO43313 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATMINO43313 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATMINO43313 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATMINO43313 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMINO43313 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATMINO43313 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATMINO43313 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATMINO43313 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATMINO43313 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATMINO43313 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATMINO43313 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATMINO43313 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATMINO43313 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATMINO43313 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATMINO43313 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATMINO43313 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATMINO43313 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATMINO43313 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATMINO43313 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMINO43313 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMINO43313 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMINO43313 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMINO43313 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMINO43313 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMINO43313 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMINO43313 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMINO43313 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMINO43313 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMINO43313 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMINO43313 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMINO43313 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMINO43313 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMINO43313 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATMINO43313 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATMINO43313 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATMINO43313 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATMINO43313 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms