Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB6O15197 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EPHB6O15197 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB6O15197 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
EPHB6O15197 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB6O15197 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB6O15197 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB6O15197 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB6O15197 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB6O15197 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms