Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO2O14787 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO2O14787 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO2O14787 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO2O14787 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO2O14787 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO2O14787 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO2O14787 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO2O14787 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO2O14787 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO2O14787 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO2O14787 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO2O14787 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO2O14787 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNPO2O14787 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO2O14787 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO2O14787 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO2O14787 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO2O14787 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO2O14787 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNPO2O14787 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNPO2O14787 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNPO2O14787 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNPO2O14787 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNPO2O14787 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TNPO2O14787 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNPO2O14787 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO2O14787 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO2O14787 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO2O14787 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO2O14787 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO2O14787 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO2O14787 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO2O14787 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO2O14787 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO2O14787 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNPO2O14787 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNPO2O14787 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO2O14787 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNPO2O14787 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO2O14787 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO2O14787 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TNPO2O14787 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO2O14787 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms