Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CUX2O14529 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CUX2O14529 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CUX2O14529 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CUX2O14529 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CUX2O14529 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CUX2O14529 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
CUX2O14529 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CUX2O14529 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CUX2O14529 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CUX2O14529 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CUX2O14529 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CUX2O14529 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CUX2O14529 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CUX2O14529 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CUX2O14529 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CUX2O14529 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CUX2O14529 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CUX2O14529 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CUX2O14529 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CUX2O14529 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CUX2O14529 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CUX2O14529 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CUX2O14529 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
CUX2O14529 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CUX2O14529 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CUX2O14529 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CUX2O14529 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CUX2O14529 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CUX2O14529 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CUX2O14529 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CUX2O14529 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CUX2O14529 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CUX2O14529 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
CUX2O14529 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CUX2O14529 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CUX2O14529 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
CUX2O14529 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CUX2O14529 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CUX2O14529 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CUX2O14529 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CUX2O14529 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CUX2O14529 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CUX2O14529 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CUX2O14529 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CUX2O14529 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CUX2O14529 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CUX2O14529 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.07■■■■■ 4.32
CUX2O14529 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CUX2O14529 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CUX2O14529 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CUX2O14529 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CUX2O14529 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CUX2O14529 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CUX2O14529 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CUX2O14529 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CUX2O14529 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CUX2O14529 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CUX2O14529 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
CUX2O14529 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CUX2O14529 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CUX2O14529 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CUX2O14529 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CUX2O14529 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CUX2O14529 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CUX2O14529 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
CUX2O14529 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CUX2O14529 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CUX2O14529 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CUX2O14529 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CUX2O14529 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CUX2O14529 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC42■■■■■ 4.31
CUX2O14529 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CUX2O14529 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CUX2O14529 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CUX2O14529 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
CUX2O14529 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CUX2O14529 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CUX2O14529 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CUX2O14529 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CUX2O14529 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CUX2O14529 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CUX2O14529 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CUX2O14529 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CUX2O14529 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CUX2O14529 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
CUX2O14529 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CUX2O14529 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CUX2O14529 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CUX2O14529 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CUX2O14529 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CUX2O14529 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CUX2O14529 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CUX2O14529 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CUX2O14529 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CUX2O14529 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CUX2O14529 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CUX2O14529 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CUX2O14529 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CUX2O14529 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms