Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MEIS1O00470 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS1O00470 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms