Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT5O00445 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT5O00445 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT5O00445 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT5O00445 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT5O00445 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT5O00445 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT5O00445 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT5O00445 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT5O00445 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT5O00445 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT5O00445 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT5O00445 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT5O00445 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT5O00445 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT5O00445 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT5O00445 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT5O00445 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT5O00445 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT5O00445 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT5O00445 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT5O00445 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT5O00445 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT5O00445 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT5O00445 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT5O00445 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT5O00445 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT5O00445 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT5O00445 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT5O00445 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT5O00445 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT5O00445 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT5O00445 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT5O00445 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT5O00445 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT5O00445 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT5O00445 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT5O00445 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT5O00445 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT5O00445 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT5O00445 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT5O00445 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT5O00445 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT5O00445 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT5O00445 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT5O00445 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT5O00445 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT5O00445 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT5O00445 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT5O00445 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT5O00445 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT5O00445 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT5O00445 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT5O00445 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT5O00445 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT5O00445 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT5O00445 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT5O00445 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT5O00445 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT5O00445 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT5O00445 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT5O00445 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT5O00445 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT5O00445 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT5O00445 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT5O00445 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT5O00445 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT5O00445 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT5O00445 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT5O00445 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms