Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN6O00399 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCTN6O00399 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN6O00399 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN6O00399 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN6O00399 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN6O00399 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN6O00399 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN6O00399 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN6O00399 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN6O00399 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN6O00399 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN6O00399 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN6O00399 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCTN6O00399 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN6O00399 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN6O00399 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN6O00399 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCTN6O00399 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms