Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
J3KTA2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
J3KTA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
J3KTA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KTA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KTA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KTA2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KTA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KTA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KTA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KTA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KTA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KTA2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KTA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KTA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KTA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KTA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KTA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KTA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KTA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KTA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KTA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KTA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KTA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KTA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KTA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KTA2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KTA2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KTA2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KTA2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KTA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KTA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KTA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KTA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KTA2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KTA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KTA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KTA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KTA2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3KTA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3KTA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KTA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KTA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KTA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KTA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KTA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KTA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KTA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KTA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KTA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KTA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KTA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KTA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KTA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KTA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KTA2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KTA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KTA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KTA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KTA2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KTA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KTA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KTA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KTA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KTA2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KTA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.9 ms